FungiRESIST™ : Une plateforme innovante pour l’analyse des résistances fongiques

Objectifs scientifiques

FungiRESIST™ permet :

• Caractérisation structurale des populations pathogènes à partir d’une seule analyse.
• Quantification des allèles et haplotypes associés aux mutations de résistance.
• Détection de nouvelles modifications des gènes cibles, ouvrant la voie à la surveillance évolutive.
• Visualisation interactive des données pour une interprétation spatiale en temps réel.

Technologie et méthodologie

• Séquençage longue lecture (Oxford Nanopore Technologies) : idéal pour reconstruire des haplotypes complets et analyser des régions génétiques complexes.
• Pipeline optimisé pour les gènes cibles des fongicides : CYP51 (Zymoseptoria tritici), CYTB (Plasmopara viticola), et autres.
• Analyse quantitative des mutations connues (ex. S524T, Y461H, G143A) et des combinaisons haplotypiques.
• Résultats rapides : quelques jours suffisent pour obtenir des données exploitables, contre plusieurs semaines avec des approches classiques.

Applications

• Surveillance épidémiologique des résistances dans les populations fongiques.
• Aide à la décision pour la gestion raisonnée des fongicides.
• Recherche fondamentale sur la dynamique évolutive des mutations.

Exemple : Zymoseptoria tritici

Les haplotypes complexes tels que D134G-V136A-I381V-Y461H-S524T sont suivis pour évaluer la fréquence des combinaisons multi-mutations dans les populations. Cette approche permet de mieux comprendre la corrélation entre génotype et phénotype de résistance.

Pourquoi choisir FungiRESIST™ ?

• Expertise éprouvée : plus de 15 ans d’expérience dans la détection des allèles de résistance.
• Interface intuitive : analyse, illustration et cartographie interactive.
• Adaptabilité : compatible avec vos échantillons ou vos données ONT existantes.

Pour en savoir plus ou tester la plateforme :

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