Laboratoire en microbiologie 5 Technologie NGS

La technique NGS : une révolution dans le séquençage ADN !

Le séquençage de nouvelle génération (NGS), a révolutionné le domaine de la biologie moléculaire. Chez Conidia Coniphy, nous mettons notre expertise technique et scientifique à votre disposition pour vous offrir des solutions sur mesure en séquençage NGS, adaptées à vos besoins spécifiques.

Le séquençage de nouvelle génération : la définition !

Le séquençage de nouvelle génération (NGS) a propulsé l’analyse de l’ADN. En générant massivement des données à partir de millions de fragments d’ADN simultanément, le NGS a rendu le séquençage plus rapide et plus abordable.

Cette technologie, principalement basée sur le séquençage par synthèse d’illumina, produit des lectures courtes d’ADN. Grâce à sa puissance, le NGS est devenu un outil indispensable dans de nombreux domaines de la biologie, de la recherche fondamentale à la médecine personnalisée.

Le principe du séquençage NGS : comment ça marche ?

La technique NGS repose sur plusieurs étapes, depuis la préparation de l’échantillon jusqu’à l’analyse des résultats. Voici les principales phases d’une cas pratique chez CONIDIA CONIPHY : Suivi des résistances aux fongicides des maladies des plantes

Préparation de l’échantillon

L’ADN à analyser est extrait et purifié.

Amplification

Chaque fragment (gène) est copié plusieurs fois pour garantir une meilleure lecture.

Séquençage

Les fragments sont séquencés simultanément, produisant une grande quantité de données.

Analyse des données

Les résultats sont ensuite assemblés et interprétés grâce à des algorithmes puissants, permettant d’identifier des mutations, des variations génétiques ou d’autres informations clés.

Pipeline d’analyse

Des outils de bio-informatiques spécifiques à chaque projet et accessible/facile à utiliser.

Pourquoi choisir Conidia Coniphy pour vos analyses NGS ?

L’innovation est dans l’ADN de notre société.

Pour répondre aux défis actuels, notre société dispose d’une équipe R&D dédiée aux projets innovants. Composée de docteur et d’ingénieur, elle développe les outils de demain et apporte des outils pratiques (développement de kit de biologie moléculaire) pour être au plus près du terrain.

Notre ADN inclut :

  •  Une expertise reconnue en biologie moléculaire et en technique NGS.
  •  Des solutions personnalisées adaptées à vos projets spécifiques.
  •  Un accompagnement complet de la préparation des échantillons à l’analyse des résultats.
  •  Nous sommes à votre écoute pour vous guider et vous aider à tirer le meilleur parti des différentes techniques de séquençage pour vos recherches.

 

Le NGS : l’évolution du séquençage Sanger

L’étude de l’ADN a connu une révolution grâce aux progrès du séquençage. Le séquençage Sanger, pionnier dans le domaine, a ouvert la voie au projet du génome humain.

Ce projet a stimulé la recherche, conduisant à l’émergence du séquençage haut débit (NGS). Plus performant, le NGS génère des quantités massives de données, nécessitant des outils bio-informatiques sophistiqués pour leur analyse.

En comparaison au Sanger, le NGS offre une capacité de séquençage nettement améliorée, permettant d’analyser simultanément un grand nombre de molécules d’ADN.

La méthode NGS enrichie par le séquençage long-read (ONT)

Le séquençage long-read ONT (Oxford Nanopore Technologies) est une technologie NGS de séquençage de 3ème génération, offrant des avantages significatifs pour certaines applications. En combinant les forces de ces deux technologies (illumina et ONT), les chercheurs peuvent obtenir une vision plus complète et précise des génomes.

Cette méthode repose sur :

L’analyse des régions complexes

du génome qui ne peuvent pas être bien résolues par les méthodes de séquençage à courts fragments.

L’étude des variations structurelles,

les répétitions et les réarrangements du génome avec une plus grande précision.

L’offre d’une vision plus complète

et détaillée du génome, utile dans des applications comme le séquençage de génomes entiers, l’étude des modifications épigénétiques, et la métagénomique.

Une méthode de choix

pour les projets nécessitant une analyse approfondie et complète du génome.

Contactez-nous pour une solution de séquençage sur mesure

Si vous cherchez à mieux comprendre ou à exploiter la technique NGS, Conidia Coniphy est votre partenaire de confiance. Nous proposons des solutions adaptées à vos besoins en séquençage de nouvelle génération. N’hésitez pas à nous contacter pour discuter de vos projets et découvrir comment nous pouvons vous accompagner dans vos recherches.

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